新風換氣機組的過濾系統分為初效、中效、亞高效和高效四種過濾器。換氣機在兩個進風口處分別設置空氣過濾器，可有效過濾空氣中的灰塵粒子、纖維等雜質，有效地阻止室外空氣中的塵埃等雜質進入室內達到凈化的目的，并確保主機的熱交換部件被污物附著而影響設備性能。

新風換氣機組工作原理是利用全熱交換器將室內排出的污濁空氣和室外送入的新鮮空氣既通過傳熱板交換溫度，同時又通過板上的微孔交換濕度，從而達到既通風換氣又保持室內溫、濕度穩定的效果。這就是全熱交換過程。當全熱交換器在夏季制冷期運行時，新風從排風中獲得冷量，使溫度降低，同時被排風干燥，使新風濕度降低；在冬季運行時，新風從排風中獲得熱量，使溫度升高，同時被排風加濕。